Brütten führt keine eigene Sekundarstufe. Nach der Primarschule besuchen die Kinder die Sekundarstufe in Nürensdorf. Diese wird als Sekundarstufe A und Sekundarstufe B mit den Niveaufächern Englisch und Mathematik geführt. Dank integrierter Fördermassnahmen wird die Sekundarstufe allen Kindern gerecht.
Ein Teil der Kosten an das Busticket wird den Eltern zurückerstattet.